Ao levar a cabo a sua missão, a Indústria Farmacêutica defende elevados padrões éticos e de qualidade, a que se aliam a responsabilidade social e o dever de solidariedade. O objectivo primordial da APIFARMA é, através da prestação de serviços às empresas associadas, defender os interesses comuns dos seus associados, abrangendo ao mesmo tempo, todos os campos multidisciplinares relevantes para o sector, nomeadamente:

• Defesa de elevados padrões de qualidade, segurança e eficácia dos medicamentos produzidos;
• Protecção dos direitos da propriedade industrial;
• Defesa de um sistema de aprovação de medicamentos célere e eficiente;
• Proximidade com o Doente como primeiro destinatário da actividade;
• Interacção com a comunidade científica, quer pela permuta do conhecimento, quer pela preservação do património científico;
• Promoção de uma cultura de defesa ambiental, como salvaguarda da Saúde Pública;
• Proximidade com a Comunidade para divulgação da sua missão e valores;
• Respeito integral pela legislação aplicável, não admitindo qualquer forma de trabalho forçado ou compulsório nem de trabalho infantil no desenvolvimento das suas actividades.